MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 101673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015564	ACC	2	6	206376	206381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917867
4502	NC_015564	GCG	2	6	206519	206524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917867
4503	NC_015564	TGG	2	6	206532	206537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917867
4504	NC_015564	CGA	2	6	206554	206559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917867
4505	NC_015564	CGT	2	6	206614	206619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917867
4506	NC_015564	AGCG	2	8	206637	206644	25 %	0 %	50 %	25 %	333917867
4507	NC_015564	CGG	2	6	206659	206664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917867
4508	NC_015564	GCG	2	6	206670	206675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917867
4509	NC_015564	GGGAC	2	10	206699	206708	20 %	0 %	60 %	20 %	333917867
4510	NC_015564	CAG	2	6	206723	206728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917867
4511	NC_015564	CGAA	2	8	206788	206795	50 %	0 %	25 %	25 %	333917867
4512	NC_015564	CGTC	2	8	206897	206904	0 %	25 %	25 %	50 %	333917868
4513	NC_015564	GCA	2	6	206917	206922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917868
4514	NC_015564	TCT	2	6	206924	206929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917868
4515	NC_015564	CGT	2	6	207002	207007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917868
4516	NC_015564	GTG	2	6	207021	207026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917868
4517	NC_015564	AGG	2	6	207028	207033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917868
4518	NC_015564	CGA	2	6	207078	207083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917868
4519	NC_015564	GC	3	6	207131	207136	0 %	0 %	50 %	50 %	333917868
4520	NC_015564	TGG	2	6	207170	207175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917868
4521	NC_015564	ACC	2	6	207202	207207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917868
4522	NC_015564	GCGT	2	8	207233	207240	0 %	25 %	50 %	25 %	333917868
4523	NC_015564	TACC	2	8	207287	207294	25 %	25 %	0 %	50 %	333917868
4524	NC_015564	GC	3	6	207402	207407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4525	NC_015564	GC	3	6	207485	207490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4526	NC_015564	TCCG	2	8	207511	207518	0 %	25 %	25 %	50 %	333917869
4527	NC_015564	AAG	2	6	207535	207540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917869
4528	NC_015564	ATC	2	6	207559	207564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917869
4529	NC_015564	CGT	2	6	207599	207604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917869
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4533	NC_015564	CGG	2	6	207753	207758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917869
4534	NC_015564	TGGACG	2	12	207764	207775	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333917869
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4536	NC_015564	ACG	2	6	207839	207844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917869
4537	NC_015564	CCTGA	2	10	207874	207883	20 %	20 %	20 %	40 %	333917869
4538	NC_015564	AGCG	2	8	207948	207955	25 %	0 %	50 %	25 %	333917869
4539	NC_015564	GGC	2	6	208020	208025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917869
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4542	NC_015564	TGC	2	6	208126	208131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917870
4543	NC_015564	GCA	2	6	208184	208189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917870
4544	NC_015564	GTC	2	6	208216	208221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917870
4545	NC_015564	TCC	2	6	208231	208236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917870
4546	NC_015564	AGT	2	6	208263	208268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917870
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4549	NC_015564	CTT	2	6	208439	208444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917870
4550	NC_015564	TGCGT	2	10	208447	208456	0 %	40 %	40 %	20 %	333917870
4551	NC_015564	TGA	2	6	208472	208477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917870
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4553	NC_015564	CGA	2	6	208523	208528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917870
4554	NC_015564	CTG	2	6	208556	208561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917870
4555	NC_015564	GCC	3	9	208579	208587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917870
4556	NC_015564	CGT	2	6	208589	208594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917870
4557	NC_015564	GCT	2	6	208659	208664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917870
4558	NC_015564	GCA	2	6	208693	208698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917870
4559	NC_015564	TCGG	2	8	208699	208706	0 %	25 %	50 %	25 %	333917870
4560	NC_015564	TAG	2	6	208716	208721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917870
4561	NC_015564	CGGC	2	8	208814	208821	0 %	0 %	50 %	50 %	333917870
4562	NC_015564	CGC	2	6	208938	208943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917870
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4564	NC_015564	GGCGA	2	10	209223	209232	20 %	0 %	60 %	20 %	333917870
4565	NC_015564	GAA	2	6	209297	209302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917870
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4567	NC_015564	GTTC	2	8	209357	209364	0 %	50 %	25 %	25 %	333917870
4568	NC_015564	CGC	2	6	209404	209409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917871
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4570	NC_015564	C	6	6	209480	209485	0 %	0 %	0 %	100 %	333917871
4571	NC_015564	GCC	2	6	209565	209570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917871
4572	NC_015564	TCG	2	6	209589	209594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917871
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4574	NC_015564	TTCGC	2	10	209619	209628	0 %	40 %	20 %	40 %	333917871
4575	NC_015564	TGCC	2	8	209656	209663	0 %	25 %	25 %	50 %	333917871
4576	NC_015564	AGCG	2	8	209693	209700	25 %	0 %	50 %	25 %	333917871
4577	NC_015564	GC	3	6	209774	209779	0 %	0 %	50 %	50 %	333917871
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4580	NC_015564	CAGCC	2	10	209932	209941	20 %	0 %	20 %	60 %	333917871
4581	NC_015564	TCC	2	6	209969	209974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917871
4582	NC_015564	CGTC	2	8	209982	209989	0 %	25 %	25 %	50 %	333917871
4583	NC_015564	CACG	2	8	210001	210008	25 %	0 %	25 %	50 %	333917871
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4586	NC_015564	CGA	3	9	210115	210123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917871
4587	NC_015564	CTG	2	6	210171	210176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917871
4588	NC_015564	CGT	2	6	210178	210183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917871
4589	NC_015564	CCA	2	6	210213	210218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917871
4590	NC_015564	CGCA	2	8	210260	210267	25 %	0 %	25 %	50 %	333917871
4591	NC_015564	CAC	2	6	210335	210340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917871
4592	NC_015564	GC	3	6	210416	210421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4593	NC_015564	GC	3	6	210445	210450	0 %	0 %	50 %	50 %	333917872
4594	NC_015564	CA	3	6	210454	210459	50 %	0 %	0 %	50 %	333917872
4595	NC_015564	ATG	2	6	210462	210467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917872
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4599	NC_015564	CTG	2	6	210677	210682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917872
4600	NC_015564	GCG	2	6	210698	210703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917872
4601	NC_015564	CGA	2	6	210778	210783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917872
4602	NC_015564	TGA	2	6	210846	210851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917872
4603	NC_015564	GAT	2	6	210898	210903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917872
4604	NC_015564	GCC	2	6	210935	210940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917872
4605	NC_015564	TCCA	2	8	210950	210957	25 %	25 %	0 %	50 %	333917872
4606	NC_015564	CGA	2	6	210968	210973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_015564	GAC	2	6	211023	211028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_015564	TCA	2	6	211069	211074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_015564	GGCA	2	8	211079	211086	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4610	NC_015564	GAC	2	6	211184	211189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917873
4611	NC_015564	CTCG	2	8	211239	211246	0 %	25 %	25 %	50 %	333917873
4612	NC_015564	CGG	2	6	211323	211328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917873
4613	NC_015564	TTC	2	6	211395	211400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917873
4614	NC_015564	GC	3	6	211503	211508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4615	NC_015564	CCGCCA	2	12	211556	211567	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4616	NC_015564	TG	4	8	211580	211587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_015564	TTTC	2	8	211602	211609	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4618	NC_015564	ACC	2	6	211739	211744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4619	NC_015564	GAC	2	6	211774	211779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_015564	CT	3	6	211826	211831	0 %	50 %	0 %	50 %	333917874
4621	NC_015564	GCC	3	9	211832	211840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917874
4622	NC_015564	TCC	2	6	211845	211850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917874
4623	NC_015564	CAT	2	6	211858	211863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917874
4624	NC_015564	CCA	2	6	211868	211873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917874
4625	NC_015564	CAC	2	6	211927	211932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917874
4626	NC_015564	AGC	2	6	211973	211978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917874
4627	NC_015564	AGC	2	6	211988	211993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917874
4628	NC_015564	AGC	2	6	212003	212008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917874
4629	NC_015564	AGC	2	6	212018	212023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917874
4630	NC_015564	AGC	2	6	212033	212038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917874
4631	NC_015564	GAA	2	6	212054	212059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917874
4632	NC_015564	CCA	2	6	212109	212114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917874
4633	NC_015564	CGA	2	6	212203	212208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917874
4634	NC_015564	GAGG	2	8	212219	212226	25 %	0 %	75 %	0 %	333917874
4635	NC_015564	GGCA	2	8	212317	212324	25 %	0 %	50 %	25 %	333917874
4636	NC_015564	CAC	2	6	212347	212352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917874
4637	NC_015564	GATC	2	8	212392	212399	25 %	25 %	25 %	25 %	333917874
4638	NC_015564	CGT	2	6	212401	212406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917874
4639	NC_015564	GC	3	6	212433	212438	0 %	0 %	50 %	50 %	333917874
4640	NC_015564	CAG	2	6	212516	212521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917874
4641	NC_015564	GTGACG	2	12	212526	212537	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333917874
4642	NC_015564	TTG	2	6	212661	212666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917874
4643	NC_015564	GCG	2	6	212670	212675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917874
4644	NC_015564	GCC	3	9	212776	212784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917874
4645	NC_015564	ACG	2	6	212949	212954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917874
4646	NC_015564	GCGCT	2	10	213038	213047	0 %	20 %	40 %	40 %	333917875
4647	NC_015564	TCG	2	6	213077	213082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917875
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4649	NC_015564	GCC	2	6	213189	213194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917875
4650	NC_015564	GGC	2	6	213228	213233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917875
4651	NC_015564	ACC	2	6	213243	213248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917875
4652	NC_015564	CGA	2	6	213276	213281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917875
4653	NC_015564	ACG	2	6	213358	213363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917875
4654	NC_015564	TAC	2	6	213403	213408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917875
4655	NC_015564	AGCG	2	8	213412	213419	25 %	0 %	50 %	25 %	333917875
4656	NC_015564	GTCG	2	8	213520	213527	0 %	25 %	50 %	25 %	333917875
4657	NC_015564	GAA	2	6	213591	213596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917875
4658	NC_015564	TC	3	6	213646	213651	0 %	50 %	0 %	50 %	333917876
4659	NC_015564	GAT	2	6	213699	213704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917876
4660	NC_015564	GTG	2	6	213800	213805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4661	NC_015564	GC	3	6	213832	213837	0 %	0 %	50 %	50 %	333917877
4662	NC_015564	CGC	2	6	213935	213940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917877
4663	NC_015564	GCG	2	6	213951	213956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917877
4664	NC_015564	CGG	2	6	214035	214040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917877
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4666	NC_015564	TCG	2	6	214070	214075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917877
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4670	NC_015564	ACG	2	6	214178	214183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917878
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4680	NC_015564	AAGA	2	8	214565	214572	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4681	NC_015564	GC	3	6	214584	214589	0 %	0 %	50 %	50 %	333917879
4682	NC_015564	TTG	2	6	214601	214606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917879
4683	NC_015564	CAT	2	6	214608	214613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917879
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4688	NC_015564	CGGCG	2	10	214722	214731	0 %	0 %	60 %	40 %	333917879
4689	NC_015564	CG	3	6	214805	214810	0 %	0 %	50 %	50 %	333917879
4690	NC_015564	GCGG	2	8	214851	214858	0 %	0 %	75 %	25 %	333917879
4691	NC_015564	GT	3	6	214972	214977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4692	NC_015564	TGA	2	6	214985	214990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4694	NC_015564	GAG	2	6	215115	215120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917880
4695	NC_015564	CGA	3	9	215160	215168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917880
4696	NC_015564	CGT	2	6	215295	215300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917880
4697	NC_015564	ACT	2	6	215438	215443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917880
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4700	NC_015564	TGA	2	6	215498	215503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917880
4701	NC_015564	TCCG	2	8	215555	215562	0 %	25 %	25 %	50 %	333917880
4702	NC_015564	TGG	2	6	215600	215605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917880
4703	NC_015564	CCTCG	2	10	215622	215631	0 %	20 %	20 %	60 %	333917880
4704	NC_015564	ATC	2	6	215701	215706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917880
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4706	NC_015564	GCAGTG	2	12	215941	215952	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333917881
4707	NC_015564	GCA	2	6	215980	215985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917881
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4712	NC_015564	TG	3	6	216198	216203	0 %	50 %	50 %	0 %	333917881
4713	NC_015564	GAA	2	6	216356	216361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917882
4714	NC_015564	TGC	2	6	216374	216379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917882
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4717	NC_015564	CG	3	6	216467	216472	0 %	0 %	50 %	50 %	333917882
4718	NC_015564	ACT	2	6	216484	216489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917882
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4721	NC_015564	GCT	2	6	216602	216607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917882
4722	NC_015564	TCA	2	6	216698	216703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917882
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4724	NC_015564	CG	3	6	216717	216722	0 %	0 %	50 %	50 %	333917882
4725	NC_015564	GCA	2	6	216732	216737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917882
4726	NC_015564	ACGG	2	8	216752	216759	25 %	0 %	50 %	25 %	333917882
4727	NC_015564	CGA	2	6	216805	216810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917882
4728	NC_015564	CAG	2	6	216826	216831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917882
4729	NC_015564	CGGA	2	8	216860	216867	25 %	0 %	50 %	25 %	333917882
4730	NC_015564	TCG	2	6	216901	216906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917882
4731	NC_015564	GCA	2	6	216917	216922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917882
4732	NC_015564	GTC	2	6	216944	216949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917882
4733	NC_015564	ACCT	2	8	216980	216987	25 %	25 %	0 %	50 %	333917883
4734	NC_015564	CGA	2	6	217092	217097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917883
4735	NC_015564	CGCT	2	8	217198	217205	0 %	25 %	25 %	50 %	333917883
4736	NC_015564	CGA	2	6	217237	217242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917883
4737	NC_015564	GGC	2	6	217255	217260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917883
4738	NC_015564	GGA	2	6	217264	217269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917883
4739	NC_015564	GCT	2	6	217390	217395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917883
4740	NC_015564	ATGCTG	2	12	217425	217436	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333917883
4741	NC_015564	GAA	2	6	217517	217522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917883
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4743	NC_015564	TCG	2	6	217635	217640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917883
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4985	NC_015564	CA	3	6	229120	229125	50 %	0 %	0 %	50 %	333917894
4986	NC_015564	CGA	2	6	229181	229186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917894
4987	NC_015564	TCA	2	6	229240	229245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917894
4988	NC_015564	ATGG	2	8	229257	229264	25 %	25 %	50 %	0 %	333917894
4989	NC_015564	GAAG	2	8	229292	229299	50 %	0 %	50 %	0 %	333917894
4990	NC_015564	GAC	2	6	229395	229400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917894
4991	NC_015564	GC	3	6	229403	229408	0 %	0 %	50 %	50 %	333917894
4992	NC_015564	GATG	2	8	229412	229419	25 %	25 %	50 %	0 %	333917894
4993	NC_015564	TGC	2	6	229435	229440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917894
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4998	NC_015564	CGCC	2	8	229687	229694	0 %	0 %	25 %	75 %	333917895
4999	NC_015564	CAT	2	6	229710	229715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917895
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